Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp1Q01514 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp1Q01514 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp1Q01514 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gbp1Q01514 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp1Q01514 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp1Q01514 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp1Q01514 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp1Q01514 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp1Q01514 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp1Q01514 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp1Q01514 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp1Q01514 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp1Q01514 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp1Q01514 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp1Q01514 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp1Q01514 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp1Q01514 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp1Q01514 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp1Q01514 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp1Q01514 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp1Q01514 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp1Q01514 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp1Q01514 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp1Q01514 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp1Q01514 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp1Q01514 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp1Q01514 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp1Q01514 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms