Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms