Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms