Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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