Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfi1P70338 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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