Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NficP70255 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NficP70255 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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NficP70255 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NficP70255 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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