Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Hoxd13P70217 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd13P70217 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Hoxd13P70217 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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