Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms