Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms