Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tpm2P58774 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tpm2P58774 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tpm2P58774 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tpm2P58774 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm2P58774 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm2P58774 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm2P58774 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm2P58774 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm2P58774 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm2P58774 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms