Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms