Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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