Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms