Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpardP35396 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpardP35396 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpardP35396 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpardP35396 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpardP35396 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpardP35396 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpardP35396 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpardP35396 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpardP35396 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpardP35396 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpardP35396 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PpardP35396 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpardP35396 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PpardP35396 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpardP35396 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpardP35396 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpardP35396 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpardP35396 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpardP35396 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpardP35396 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpardP35396 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpardP35396 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpardP35396 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpardP35396 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpardP35396 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpardP35396 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpardP35396 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpardP35396 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PpardP35396 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpardP35396 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpardP35396 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpardP35396 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpardP35396 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpardP35396 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpardP35396 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PpardP35396 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpardP35396 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpardP35396 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpardP35396 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpardP35396 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpardP35396 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpardP35396 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpardP35396 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PpardP35396 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpardP35396 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpardP35396 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpardP35396 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpardP35396 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpardP35396 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpardP35396 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpardP35396 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PpardP35396 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PpardP35396 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpardP35396 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpardP35396 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpardP35396 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpardP35396 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpardP35396 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpardP35396 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpardP35396 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpardP35396 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpardP35396 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpardP35396 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpardP35396 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpardP35396 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpardP35396 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpardP35396 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpardP35396 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpardP35396 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpardP35396 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms