Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms