Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh15P33146 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms