Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms