Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrbP28704 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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