Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms