Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms