Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms