Protein–RNA interactions for Protein: P18826

Phka1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phka1P18826 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phka1P18826 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Phka1P18826 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Phka1P18826 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phka1P18826 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phka1P18826 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phka1P18826 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phka1P18826 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phka1P18826 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phka1P18826 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phka1P18826 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phka1P18826 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phka1P18826 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phka1P18826 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phka1P18826 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phka1P18826 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phka1P18826 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phka1P18826 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phka1P18826 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phka1P18826 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phka1P18826 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phka1P18826 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phka1P18826 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phka1P18826 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phka1P18826 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phka1P18826 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phka1P18826 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phka1P18826 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phka1P18826 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phka1P18826 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phka1P18826 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phka1P18826 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Phka1P18826 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phka1P18826 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phka1P18826 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Phka1P18826 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phka1P18826 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phka1P18826 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Phka1P18826 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phka1P18826 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms