Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18529 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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P18529 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18529 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18529 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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