Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms