Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lire1P11260 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lire1P11260 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lire1P11260 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lire1P11260 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lire1P11260 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms