Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P04213 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04213 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P04213 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04213 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04213 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P04213 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04213 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04213 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04213 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04213 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04213 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04213 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04213 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04213 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04213 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04213 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04213 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04213 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04213 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04213 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04213 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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P04213 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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P04213 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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P04213 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04213 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms