Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ccl20O89093 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ccl20O89093 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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