Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20bO88575 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms