Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DffaO54786 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
DffaO54786 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DffaO54786 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
DffaO54786 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DffaO54786 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DffaO54786 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DffaO54786 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
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