Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms