Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms