Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms