Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 330.2 ms