Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Gm20918J3QN17 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Gm20918J3QN17 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Gm20918J3QN17 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Gm20918J3QN17 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Gm20918J3QN17 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Gm20918J3QN17 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Gm20918J3QN17 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Gm20918J3QN17 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Gm20918J3QN17 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Gm20918J3QN17 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Gm20918J3QN17 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gm20918J3QN17 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gm20918J3QN17 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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