Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms