Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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