Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms