Protein–RNA interactions for Protein: F6TVX7

Gm20671, Predicted gene 20671 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20671F6TVX7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gm20671F6TVX7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20671F6TVX7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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