Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms