Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

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Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Prdm16A2A935 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prdm16A2A935 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Prdm16A2A935 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prdm16A2A935 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Prdm16A2A935 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prdm16A2A935 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prdm16A2A935 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Prdm16A2A935 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Prdm16A2A935 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm16A2A935 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm16A2A935 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm16A2A935 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm16A2A935 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm16A2A935 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm16A2A935 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm16A2A935 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm16A2A935 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Prdm16A2A935 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Prdm16A2A935 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Prdm16A2A935 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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