Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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