Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vstm4T1NXB5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Vstm4T1NXB5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vstm4T1NXB5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms