Protein–RNA interactions for Protein: S4R1R7

Rpl9-ps1, MCG50795, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl9-ps1S4R1R7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl9-ps1S4R1R7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms