Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Robo3Q9Z2I4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Robo3Q9Z2I4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Robo3Q9Z2I4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 614.9 ms