Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gipc2Q9Z2H7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gipc2Q9Z2H7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms