Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema4fQ9Z123 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4fQ9Z123 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4fQ9Z123 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms