Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx1Q9WV80 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx1Q9WV80 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snx1Q9WV80 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snx1Q9WV80 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx1Q9WV80 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx1Q9WV80 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx1Q9WV80 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms