Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ntn3Q9R1A3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms