Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpxQ9R0M3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms