Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtsjQ9R014 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtsjQ9R014 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtsjQ9R014 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtsjQ9R014 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtsjQ9R014 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtsjQ9R014 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtsjQ9R014 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtsjQ9R014 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtsjQ9R014 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtsjQ9R014 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtsjQ9R014 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtsjQ9R014 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtsjQ9R014 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtsjQ9R014 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtsjQ9R014 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtsjQ9R014 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CtsjQ9R014 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtsjQ9R014 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms